Seit 1815 Apothekerlehre in Ffm. Seit 1818 Studium der Medizin und Chirurgie in Heidelberg. 1822 Promotion in Heidelberg. Tätigkeit am Rijksmuseum in Leiden. M. unternahm ab Ende 1825 ausgedehnte Forschungsreisen nach Südostasien. Er sammelte und katalogisierte im westlichen Timor 167 verschiedene Gesteinsarten; auf dieser Grundlage konnte die erste geologische Übersichtskarte dieses Gebiets erstellt werden. 1832 auf der Insel Java von aufständischen Landwirtschaftsarbeitern getötet.
Mitglied der Ffter Naturforschungskommission.
Nach M. sind u. a. die Gesteinsart „Pteropus Mackloti Temminck“ und eine Pflanzengattung „Macklotia“ benannt.